Depuis 2002, Agropolis International héberge dans ses locaux le Labex Europe de l’Embrapa et joue le rôle de portail d’accès et de facilitateur pour l'Embrapa et ses partenaires locaux. Le Labex Europe de l’Embrapa a pour mission l’affectation temporaire de chercheurs brésiliens confirmés dans des laboratoires de pointe situés en France et en Europe.

Ces scientifiques participent activement aux recherches des équipes d’accueil tout en assurant une veille scientifique et technologique dans leur domaine de compétence.

Aujourd’hui, quatre chercheurs brésiliens sont affectés dans le Programme Labex Europe.